一种共调控基因聚类的新方法

摘要：

定义了一种基于滑动匹配的相似度,并在此基础上提出一种能够自适应确定聚类数目的全局K-均值算法,解决了现有共调控基因聚类方法无法考虑到基因的正反、延时、部分时间和差异表达全部4种共调控关系的问题. 将提出的算法应用于微阵列数据中,并将实验结果与CLUSTER 3.0算法进行了比较,验证了算法的可行性和有效性.

关键词：共调控基因、聚类、全局K-均值、相似度度量

所属期刊栏目：47

分类号：TP311(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60433020,60673099,60773095;国家高技术研究发展计划863项目基金2007AA04Z114;吉林大学"985工程"项目基金、欧盟项目TH/Asia Link/010111084;教育部"符号计算与知识工程"重点实验室项目基金93K-17

在线出版日期：2009-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：292-298