竹叶花椒MYB基因家族的鉴定及其表达特性的分析

摘要：

[目的]利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据,为后续的无刺竹叶花椒品种的基因工程培育奠定理论基础.[方法]利用生物信息学方法,从测序获得的竹叶花椒转录组数据库中筛选MYB转录因子,对其蛋白基序、理化性质、系统进化关系、基因表达特性等进行分析,并利用qRT-PCR技术和基因克隆,对所选基因进行验证.[结果]从竹叶花椒中共鉴定出39条MYB转录因子序列,其中包括9个R1-MYB型基因、28个R2R3-MYB型基因、1个R3型基因和1个R4型基因.对其蛋白理化性质的分析结果表明:39个MYB转录因子所含氨基酸数量为101～621个,其均为可溶性蛋白,而其二级结构以无规则卷曲为主.亚细胞定位预测结果显示:39个MYB转录因子定位于细胞核的可能性最大,这符合转录因子调控下游基因的表达特性.基因表达情况的分析结果显示:部分MYB转录因子在竹叶花椒同一组织的不同发育时期的表达差异显著,其中ZaMYB10、ZaMYB23和ZaMYB25这3个基因的表达量随着皮刺的不断发育均呈逐渐增长的趋势,表明这3个基因可能与皮刺的生长发育相关.qRT-PCR分析结果表明:ZaMYB10基因在皮刺中有特异表达.基因克隆结果表明:ZaMYB10基因具有长为1032 bp的完整的cDNA开放阅读框,其编码343个氨基酸.[结论]鉴定出39个竹叶花椒MYB转录因子,其均包含SANT保守结构域,根据表达模式判断,其中的ZaMYB10转录因子可能参与了竹叶花椒皮刺生长发育的调控.

关键词：竹叶花椒;MYB;皮刺;生物信息学分析;基因表达分析

所属期刊栏目：39

分类号：S603;S573(一般性问题)

资助基金：云南省重点研发计划项目202102AE090013

在线出版日期：2022-01-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：148-157