适合转录组测序的芒果不同组织 RNA试剂盒提取方法研究

摘要：

为了探寻能够满足芒果各组织转录组测序要求的高质量RNA提取方法,以'桂热芒82号'的叶片、花和果实为材料,从RNA提取质量和产率、琼脂糖电泳和RT-PCR结果分析、RNA测序质量评价这3个方面,对常用的3种试剂盒的提取效果进行了实验研究和评价分析.结果表明:以来自于天根生化科技有限公司的DP 419试剂盒提取的芒果各组织的RNA质量均较好,提取的RNA产率远高于其余两种试剂盒的提取产率;除以美伯生物医药技术有限公司的RM 103试剂盒提取芒果各组织所得RNA,经琼脂糖电泳未见有5S条带出现外,以其余两种试剂盒提取的芒果各组织的RNA都存在28S、18S、5S条带且RT-PCR分析结果理想;对以3种试剂盒提取所得的RNA进行完全测序,结果表明,3种试剂盒提取的RNA完全测序都大于98.99％,能满足RNA-Seq分析的要求.文中综合上述评判因素分析认为,天根生化科技有限公司的DP 419试剂盒是适用于芒果叶片、花和果实RNA提取的最优试剂盒.

关键词：芒果、RNA、试剂盒、测序

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分类号：S667.7(果树园艺)

资助基金：广西自然科学基金项目2015GXNSFBA139085,2016GXNSFAA380164;广西亚热带作物研究所基本科研业务费专项桂热研201807;现代农业产业技术体系广西创新团队建设专项nycytxgxcxtd-06-01;农业部农垦局热作技术试验示范与服务支持项目151821301064072703

在线出版日期：2019-04-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：32-36