杜仲转录组微卫星特征分析

摘要：

为给杜仲SSR分子标记的选择提供参考依据，利用MISA软件对杜仲转录组序列进行了微卫星查找，共获得重复单元长度为1～6碱基的29067个微卫星序列。分析这些微卫星序列后发现，在杜仲转录组中，长度为二核苷酸的微卫星重复单元最为丰富，占43.7%；在单碱基重复和二碱基重复这两种类型中，最主要的优势重复单元分别是A/T和AG/CT；在三碱基、四碱基、五碱基重复类型中，(AAN)n、(ANAT)n、(AANAN)n分别为其对应的优势重复单元。杜仲转录组中，微卫星的频率随着微卫星总长度的增加而降低。

关键词：杜仲、转录组、微卫星

所属期刊栏目：34

分类号：S603.2;S722.3+1(一般性问题)

资助基金：林业公益性行业科研专项;湖南省自然科学基金创新研究群体项目

在线出版日期：2016-12-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：47-51