葡萄WRKY转录因子家族全基因组分析

摘要：

为了给进一步开展葡萄WRKY基因家族的功能和分子进化机制的研究提供理论依据,利用葡萄全基因组数据,采用生物信息学的方法,在葡萄全基因组水平上对葡萄WRy基因家族进行了系谱进化关系、保守模体、共线性关系及表达情况等方面的分析.结果表明,葡萄基因组中共存在55个WRKY基因,命名为VvWRKY1～VvWRKY55,这些WRKY基因归属于7个亚家族.共线性分析结果表明,亚家族Ⅱb的6个成员可能起源于形成葡萄物种的“古代六倍体化”事件.对公共数据库中葡萄RNA-Seq数据的分析结果表明,有9个WRKY基因对生物和非生物胁迫有响应.

关键词：葡萄、WRKY基因、生物信息学、进化、全基因组分析

所属期刊栏目：31

分类号：S663.1(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目31201607

在线出版日期：2014-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：127-131