杜仲MEP途径系列基因5'端非编码区的顺式作用元件预测

摘要：

为深入了解杜仲MEP途径基因5'端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5'端非编码区顺式作用元件的结构和功能.生物信息学分析表明:EuDXS2基因5'端非编码区预测出共有22种共220个顺式作用元件,其中包含启动子顺式元件145个TATA-box和39个CAAT-box的可能位点;EuDXR基因5'端非编码区预测出21种共127个顺式作用元件,68个TATA-box和32个CAAT-box; EuCMK基因5 '端非编码区预测出24种共134个顺式作用元件,包含32个CAAT-box和68个TATA-box; EuMDS基因5'端非编码区共预测出30种共104个顺式作用元件,其中43个CAAT-box和23个TATA-box; EuHDS基因5'端非编码区预测出35种共126个顺式作用元件,包括29个CAAT-box和34个TATA-box; EuHDR基因5'端非编码区预测出24种共115个顺式作用元件,包含19个CAAT-box和67个TATA-box.

关键词：杜仲、MEP途径、5'端非编码区、顺式作用元件

所属期刊栏目：31

分类号：S603.2(一般性问题)

资助基金：国家林业公益性行业科研专项201004029

在线出版日期：2014-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：9-15