杜仲EuACOTS基因家族的鉴定及生物信息学分析

摘要：

乙酰CoA酰基转移酶(acetylCoA Cacetyltransferase,ACOT)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonate pathway,MVA)途径的起始酶,为了揭示生物合成杜仲胶的机制,对杜仲ACOTS基因家族进行全面的生物信息学分析.EuACOTS家族含有3个基因,分别记为EuACOT8、EuACOT9、EuACOT10.对其氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性以及同源进化等性质进行了分析,结果发现EuACOTS蛋白质的性质结构均较为相似,均存在2个硫解酶的特异保守序列,均属于稳定的疏水蛋白,无明显的跨膜区.在对EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件潜在功能的预测分析中发现,EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件进行比较发现启动子作用既有保守性,又有特异性,其中EuA CO TS家族含有大量基本顺式作用元件TATAbox,CAATbox以及光(AE-box、Box I、MNF1)、乙烯(ERE)、真菌诱导(Box-W1)和脱落酸(ABRE)等多个顺式调控元件.

关键词：杜仲、乙酰CoA、酰基转移酶、生物信息学

所属期刊栏目：31

分类号：S603.2(一般性问题)

资助基金：国家林业公益性行业科研专项201004029

在线出版日期：2014-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8