毛竹甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的克隆与序列分析

摘要：

为了分离毛竹抗逆相关基因,利用RT-PCR和RACE技术,从毛竹叶片中克隆出甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因PeGAPDH的金长cDNA序列(GenBank登录号GU356597).该序列全长1 368-bp,完整阅读框1 013 bp,编码一个具有337个氨基酸残基的蛋白.利用生物信息学软件对PeGAPDH蛋白进行了分析,结果表明:PeGAPDH蛋白分子量为36.643 kDa,等电点为6.33;该蛋白含有2个保守区,即N端的NAD+结合区和靠近C端的催化功能区.PeGAPDH是一种亲水性、非分泌型蛋白,定位于膜的表面,属于氧化还原酶系,主要在中间产物代谢和能量代谢中起作用.蛋白质进化树的构建结果表明:PeGAPDH与水稻等禾本科植物来自细胞质中的GAPDH蛋白的亲缘关系很近,同双子叶植物的GAPDH则相差较远.

关键词：生物信息学、毛竹、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、基因克隆

所属期刊栏目：28

分类号：Q943.2;S795.7(植物学)

资助基金：浙江省自然科学基金Y307469

在线出版日期：2011-01-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：7-13,24