狍茸顶端组织转录组测序及生物信息学分析
为研究狍茸顶端组织的转录组信息,探讨与狍茸生长相关的基因结构及分子机理.使用Illumina HiseqTM 2000平台进行高通量测序,利用生物信息学方法进行分析.结果表明:通过测序、Trinity软件组装、比对拼接,获得了 36 865个Unigenes,平均长932 nt.经过Nr、Swiss-Prot、KEGG、COG、GO等数据库进行比对,共22 983个Unigenes成功比对上Nr数据库,18 273个Unigenes被注释到GO功能分类中,8 668个Unigenes被归类到COG的25个功能类别中.采用FPKM法筛选与狍茸生长发育相关的高表达基因,其中表达量较高的生长因子有8个,转录因子有5个,细胞外基质有8个.利用高通量转录组测序技术(RNA-seq),成功建立了狍茸顶端组织转录组数据库,可为狍茸的发育分子机理研究提供数据支持.
狍、转录组测序、狍茸顶端组织、RNA-seq技术
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S825.2(家畜)
国家重点研发计划;中央高校基本科研业务费专项资金项目
2022-09-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
107-112
