基于生物信息学方法探讨阿尔茨海默病患者内嗅皮质组织中的免疫浸润变化

摘要：

目的:探讨阿尔茨海默病(AD)患者内嗅皮质组织样本中免疫浸润的变化.方法:从高通量基因表达(GEO)数据库下载AD患者内嗅皮质的数据集.使用Rlimma软件包对差异基因进行鉴定.通过功能注释和富集分析探讨差异基因生物学功能.用无监督聚类及单样本免疫浸润分析观察聚类模式所对应的免疫浸润类型.结果:共获得642 个差异基因以及是否进展为AD相关的A、B聚类模式.A模式富集了9 例正常对照样本及1 例AD样本.B模式富集了10 例AD样本.B模式相较A模式对应较低的简易精神状态检查评分及较高级别的Braak分期.单样本免疫浸润分析显示γδT细胞、巨噬细胞以及1 型辅助T细胞增多.基因集变异分析显示B模式富集了移植物抗宿主疾病、同种异体移植物排斥、抗原加工及提呈等免疫相关通路.最后确定了6 个因子用于风险模型的构建,预测模型训练集和验证集的受试者工作特征(ROC)曲线分别达到1.0 和0.921.结论:AD患者内嗅皮质中存在明显的免疫炎症表现,免疫炎症作为重要因素参与了AD的疾病过程.

关键词：阿尔茨海默病、免疫浸润、内嗅皮质、生物信息分析

所属期刊栏目：44

分类号：R735.7;R969.4;S813.3

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;广西自然科学基金项目

在线出版日期：2023-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1431-1438