基于加权基因共表达网络分析腹主动脉瘤免疫细胞浸润相关的关键基因

摘要：

目的:通过加权基因共表达网络分析方法筛选参与腹主动脉瘤(AAA)免疫反应机制的关键基因.方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载人AAA组织基因芯片数据集(GSE7084),其中包含10个正常主动脉样本和9个AAA样本.使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异表达基因(DEGs)对样本进行分析.鉴定具有临床意义的模块,并与DEGs取交集,利用最大团中心性(MCC)方法从交集基因中筛选出枢纽基因.同时,利用CIBERSORT分析免疫细胞的富集情况.最后,对枢纽基因与免疫细胞进行相关性分析.结果:筛选出300个DEGs和两个最具临床意义的WGCNA模块.基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析表明,这些基因在免疫反应的功能通路中显著富集,包括白细胞细胞黏附、活化、T细胞与白细胞的黏附、单核细胞迁移等.AAA和正常主动脉中浸润免疫细胞的比例不同,特别是M0巨噬细胞、活化的肥大细胞和活化的记忆CD4 T细胞.整合素β2亚基(ITGB2)和跨膜免疫信号转接器(TYROBP)是与AAA相关的前2个枢纽基因.相关分析表明,ITGB2、TYROBP与差异表达免疫细胞比例显著正相关.结论:ITGB2和TYROBP与AAA的免疫应答显著相关,可能成为诊断和治疗人AAA潜在新的治疗靶点.

关键词：腹主动脉瘤、加权基因共表达网络分析、免疫浸润、枢纽基因

所属期刊栏目：44

分类号：R735.7;R593.242;R392.1

资助基金：湖南省自然科学基金青年项目;湖南省自然科学基金青年项目;湖南省临床医疗技术创新引导项目;湖南省卫生健康委课题项目;湖南省卫生健康委课题项目;衡阳市科技局指导课题项目

在线出版日期：2023-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：859-869