外泌体相关RNA结合蛋白基因通过参与先天免疫对肝细胞癌发展的可能性影响研究

摘要：

目的:探讨外泌体相关RNA结合蛋白在肝细胞癌(HCC)中的可能功能.方法:对肿瘤微环境(TM)和生理微环境(PM)组织进行RNA测序(RNA-seq)和生物信息学分析,探讨外泌体相关RNA结合蛋白差异表达基因的生理功能,并用RT-qPCR验证实验结果.结果:在TM和PM之间发现69个参与免疫反应的外泌体相关RNA结合蛋白差异表达基因.经功能富集显示,它们共参与了12个生物学程序(BP)、4个细胞组分(CC)、1个信号通路(KEGG)和3个蛋白位点序列特征(UP-SEQ).进一步分析发现,功能主要聚集在免疫应答,尤其是先天免疫,还有参与补体激活经典途径、炎性反应等.另外引起基因多态性的SNV分析发现,这些差异表达基因的SNV与基因表达呈负相关.结论:在TM和PM中外泌体相关RNA结合蛋白基因存在差异表达,生物信息学显示其可能涉及到多个生物学过程,且可能通过参与先天免疫影响HCC发展.

关键词：外泌体、RNA结合蛋白基因、先天免疫、HCC

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资助基金：广西壮族自治区级大学生创新创业训练计划项目[项目编号:201810599046 ;广西自然科学基金[项目编号:2016GXNSFAA380177和2015

在线出版日期：2020-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1541-1544