糖尿病视网膜病变血浆差异蛋白分析

摘要：

目的 利用蛋白质组学技术寻找糖尿病视网膜病变(DR)患者血浆中的差异蛋白,为筛选DR相关血浆标志物提供依据.方法 选取在解放军第903医院诊治的2型糖尿病(T2DM)患者14例,其中合并中度以上非增殖性DR(NPDR)或增殖性DR(PDR)者作为DR组(n=8),不合并DR者作为NDR组(n=6).对患者的血浆标本利用蛋白质非标记(label-free)定量技术行液相串联质谱分析(LC-MS/MS),检测血浆中各个蛋白的表达丰度,筛选两组间的差异蛋白,对其进行生物信息学分析,包括基因本体(GO)和代谢通路(Pathway)注释,GO和Pathway富集分析、差异蛋白相互作用网络分析.结果 以均数和中位数差异倍数≥2.5倍为标准,共筛选出DR与NDR患者血浆中的差异蛋白41个,其中上调者26个,下调者15个.GO分析显示,差异蛋白中结合功能蛋白占绝对优势,生物过程中单一组织过程占比最高,细胞组分中细胞和细胞部分占比最高.Pathway富集性分析显示,上调最显著的原肌球蛋白4(TPM4)与肌肉收缩调节有关,下调最显著的血小板膜蛋白V(GPV)在细胞外基质受体相互作用中起重要作用.蛋白相互作用网络分析显示,3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)与巯基氧化酶1(QSOX1)、免疫球蛋白kappa基因座(IGK@)、TPM4、载脂蛋白C2(APOC2)、免疫球蛋白重链可变区4-31 (IGHV4-31)之间可能有相互作用;妊娠区带蛋白质(PZP)与金属蛋白酶组织抑制剂2(TIMP2)之间可能有相互作用.结论 采用蛋白质非标记定量技术发现DR与NDR患者血浆存在多种差异表达蛋白,这些差异蛋白提供了DR候选血浆标志物,并可能成为DR早期防治的候选靶点.

关键词：糖尿病性视网膜病变、蛋白质非标记定量技术、血浆蛋白质组学

所属期刊栏目：44

分类号：R587.2(内分泌腺疾病及代谢病)

资助基金：南京军区医药卫生重点项目11Z038;浙江省医药卫生科技计划项目2013KYA177;杭州市科技发展计划医药卫生及重点专科专病科研攻关专项20130633B30

在线出版日期：2019-08-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：42-50