p53转录调控靶基因GGT6对人结肠癌的影响

摘要：

目的 筛选出p53转录调控靶基因,并利用生物信息学分析该基因在结肠癌(COAD)中的作用.方法 对p53蛋白稳定剂Nutlin处理的结肠癌细胞系HCT116的RNA-seq数据进行基因差异分析及GO、KEGG和GSEA富集分析;在HCT116及HCT8细胞中加入Nutlin稳定或转染siRNA敲降p53的表达,利用实时荧光定量PCR检测候选靶基因的mRNA表达;双荧光素酶报告实验验证p53对靶基因的转录调控;利用TCGA数据库中的结肠癌数据分析靶基因在结肠癌组织中的表达及患者预后情况.结果 Nutlin处理结肠癌细胞系HCT116后细胞周期、DNA复制及染色体分离等生物过程基因表达发生变化,同样p53信号通路也被激活.在HCT116及HCT8细胞中γ-谷氨酰转移酶(GGT6)的mRNA水平与p53蛋白表达呈正相关.双荧光素酶报告实验确定了GGT6是p53转录调控的靶基因.TCGA-COAD数据分析表明GGT6在结肠癌组织中表达高于癌旁组织(P<0.001),且GGT6高表达患者的总体生存时间较GGT6低表达患者更长(P<0.01),推测GGT6是结肠癌的抑癌因素.结论 GGT6是一个p53正调控转录靶基因,在结肠癌中可能是一个抑癌因素.

关键词：p53、转录调控、γ-谷氨酰转移酶、结肠癌

所属期刊栏目：43

分类号：Q28(细胞生物学)

资助基金：国家重点研发计划;中国医学科学院医学与健康科技创新工程;细胞生态海河实验室项目;中国医学科学院医学与健康科技创新工程健康长寿先导科技专项

在线出版日期：2023-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：953-959