基于RNA-seq分析顺铂下调DRG神经元轴突导向相关基因的表达

摘要：

目的 采用转录组测序技术分析顺铂对小鼠背根神经节(DRG)神经元轴突导向相关基因表达的影响,以进一步探讨顺铂的神经毒性机制.方法 培养原代昆明小鼠DRG神经元,分为对照组和损伤组;对照组神经元直接培养24 h,损伤组神经元先培养4 h,后加入20μmol/L顺铂处理20 h;NF-200免疫荧光染色观察神经突起长度及生长锥结构;提取细胞总RNA,用RNA-seq技术分析样品,通过文献及数据库查找轴突导向直接或间接相关基因(共231个),分析两组基因表达差异;qPCR验证Cxcl12、Ext1、Gdnf、Plxna4、Nrp2、Apbb2、Sema6a,Nrp1、Nrcam、Slit1、Ank3、Ncam1、Sema7a、Dag1、Klf7、Ntn1基因表达情况.结果 与对照组相比,损伤组神经突起数量少、长度短,生长锥出现倒钩状回缩;损伤组基因表达下调数量众多,其中轴突导向相关基因下调49个;各蛋白质相互作用密切,主要集中在Ntn1、Nrp1、Nrp2、Sema6a、plxna2、plxna4、Slit2、Robo1等基因之间;qPCR验证Cxcl12、Ext1、Gdnf、Plxna4、Nrp2、Apbb2、Sema6a、Nrp1、Nrcam、Slit1、Ank3、Ncam1、Sema7a、Dag1、Klf7、Ntn1基因表达下调,与转录组测序结果一致.结论 顺铂神经毒性可能与众多轴突导向相关基因表达下调有关.

关键词：顺铂;背根神经节;轴突导向;转录组测序;差异基因

所属期刊栏目：41

分类号：Q593+.2

资助基金：国家自然科学基金;遵义医科大学硕士启动基金

在线出版日期：2021-10-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1410-1416