斑马鱼cetp基因敲除模型的建立及其肝脏转录组学分析

摘要：

目的 建立斑马鱼cetp基因敲除模型,探讨cetp基因敲除后在动脉粥样硬化中的转录组学变化.方法 采用CRISPR/Cas9基因编辑技术敲除斑马鱼cetp基因,构建cetp-/-斑马鱼模型.采用转录组测序观察cetp基因敲除后基因表达谱变化,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对差异表达基因进行功能富集分析.结果 采用CRISPR/Cas9技术敲除斑马鱼cetp基因,斑马鱼产生增加5个碱基的移码突变.转录组测序发现,cetp-/-斑马鱼肝脏基因表达谱发生显著变化,共筛选到3808个发生显著变化的基因(P<0.05),其中显著上调基因有1918个,显著下调基因1890个.脂质代谢相关基因如abca1、abcg2a基因显著上调,lipg显著下调;与自噬相关信号通路基因如atg13显著上调;下调基因富集到DNA及RNA合成、三羧酸循环等相关通路.结论 建立了斑马鱼cetp-/-模型,可用于胆固醇酯转运蛋白(CETP)在动脉粥样硬化疾病中作用机制的研究.尽管抑制CETP可使高密度脂蛋白胆固醇升高而抑制动脉粥样硬化,但是斑马鱼cetp敲除后激活机体炎性反应而促进动脉粥样硬化,提示CETP在动脉粥样硬化发生发展的过程中具有双重调节作用.

关键词：胆固醇酯转运蛋白、动脉粥样硬化性心血管疾病、CRISPR/Cas9系统、斑马鱼、转录组测序

所属期刊栏目：40

分类号：R541.4(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：国家自然科学基金;中央保健科研课题;分子发育生物学国家重点实验室开放课题;中日友好医院青年基金

在线出版日期：2020-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：940-947