基于RNA-seq的db/db小鼠大脑皮质的转录组学分析

摘要：

目的 通过对db/db和野生型(WT)小鼠大脑皮质组织全转录组学分析,探索参与调节2型糖尿病诱导的脑功能障碍的差异表达基因(DEGs)及相关通路和网络.方法 取雄性野生型WT和db/db小鼠各9只,在第8和24周检测小鼠的体质量和血糖,之后收集动物大脑皮质进行全转录组测序(RNA-seq),并进行DEGs,GO、KEGG及蛋白互作网络分析.结果 与WT组相比,db/db组大脑皮质发生变化的306个转录本中有178个表达上调,128个表达下调.DEGs中,43个上调(如Clcnka和Trim17),59个下调(如Arih1和Nectin-3).蛋白互作网络图中的13个枢纽基因均下调,且大多属于线粒体编码家族.同时,db/db小鼠在多项GO富集类别中具有显著差异,如细胞过程、细胞部分等.此外,KEGG功能富集结果显示DEGs在代谢、帕金森病(PD)、阿尔茨海默病(AD)等相关通路中高度富集,且这些富集通路中的DEGs主要影响了线粒体氧化磷酸化过程.结论 揭示了2型糖尿病与中枢神经系统损伤之间的关系及潜在的相关基因、通路及网络.

关键词：转录组测序、2型糖尿病、大脑皮质、脑功能障碍

所属期刊栏目：40

分类号：R36(病理学)

资助基金：国家自然科学基金;2018年山西省高等学校科技创新项目STIP ;山西省重点学科建设经费FSK-SC;山西省'1331工程'重点学科建设计划经费

在线出版日期：2020-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：16-23