肝癌细胞系PLC/PRF/5中染色质重塑蛋白ATRX表达的调控作用

摘要：

目的 探讨肝癌细胞中地中海贫血伴精神发育迟滞综合征基因(ATRX)对基因表达的影响及其可能机制.方法 利用CRISPR/Cas9技术敲除PLC/PRF/5细胞中的ATRX.全转录组测序技术(RNA-seq)检测ATRX敲除前后的基因表达水平,并用DESeq2软件得出差异表达基因.最后利用转座酶可及性核染色质区域分析技术(ATAC-seq)对差异基因的染色质可及性进行分析.结果 分析得到2754个差异表达基因,其中MUC16和CXCL8均在ATRX缺失后表达显著上调(P<0.05),且两基因附近都存在升高的染色质可及性的区域.结论 在肝癌细胞中,ATRX调控大量基因的表达,且可能直接参与了MUC16与CXCL8的抑制,为进一步研究ATRX在肝癌发生中的作用提供了新的线索.

关键词：ATRX、RNA-seq、ATAC-seq

所属期刊栏目：39

分类号：Q75(分子遗传学)

资助基金：国家自然科学基金 81502420

在线出版日期：2019-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：781-785