心肌层表达tRNA源性小片段RNA

摘要：

目的 研究大鼠左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)是否存在转移核糖核酸来源的小片段RNA(tRFs)的表达.方法 分离出大鼠左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)的心肌组织并提取总RNA.使用Illumina技术对小片段RNA进行测序,以获的该两个区域的50 nt以下小片段RNA的序列及表达量信息.利用Fstax和Bowtie软件,及Perl语言编程对长度为30 ～ 36 nt部分的小片段RNA进行注释,并比较两个区域tRF表达量差异.结果 大鼠心脏左心室前壁(相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区)的心肌组织存在tRF表达,而来源于tRNA的tRFs分别占总小片段RNA的9.15％和7.30％.且两个区域的经鉴别的28中tRFs种类及表达量十分接近.无论是相当于梗死区还是相当于边缘区的心肌组织,GlyGCC和ValCAC两个tRNA来源的tRFs占了所有tRFs的84.73％和84.66％.每一种tRNA来源的tRFs在两个区域间的表达差异小于4％.结论 生理状态下心肌组织存在tRF表达,相当于心肌发生梗死的梗死区和边缘区的心肌tRFs表达谱是十分接近的.

关键词：tRFs、小片段RNA、左心室前壁、心肌梗死

所属期刊栏目：36

分类号：Q522(核酸)

资助基金：国家自然科学基金30973158,81170324,81470433;863计划2007AA02Z105;科技部港澳台合作专项2012DFH30060;广东省教育厅国际合作平台项目2012gjhz0003;广东省自然科学基金重点项目04105826,S2012020010895;广东省科技厅国际合作平台项目2009B050900007,2013B051000062;广东省科技计划项目2015B020211010

在线出版日期：2016-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：907-911