通过配体文库研究GIPC2 PDZ配体结合特点及其相互作用蛋白

摘要：

目的 通过验证性筛选配体文库,获得GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,进而找到GIPC2的相互作用蛋白.方法 1)利用酵母双杂交的方法从已有的PDZ配体库中寻找与GIPC2的PDZ结构域配体结合特性;2)根据GIPC2的亚细胞定位和肿瘤相关功能再结合PDZ结构域结合序列的共同特征在蛋白质数据库中预测GIPC2的天然潜在配体;3)将天然潜在配体的C末端序列依次与GIPC2 PDZ结构域或GIPC2全长进行验证反应,从而得到阳性蛋白.结果 1)GIPC2 PDZ结构域的配体结合特性是C末端最后4个氨基酸为-X-S/T-X-V/L/I,是Ⅰ类PDZ配体;2)综合GIPC2的生物学特征和GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,在蛋白质数据库中预测得到47个天然潜在配体;3)将天然潜在配体的C末端序列克隆至酵母双杂交系统进行验证,最后得到10个确定的阳性蛋白.结论 获得10个GIPC2相互作用蛋白.

关键词：GIPC2、PDZ结构域、蛋白质相互作用、PDZ配体库、酵母双杂交

所属期刊栏目：36

分类号：Q513(蛋白质)

资助基金：国家自然科学基金31400669

在线出版日期：2016-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：186-190