ChIP-seq比较分析人体心脏和脾脏的H3K9三甲基化差异

摘要：

目的 分析人体器官心脏和脾脏的H3K9me3的全基因图谱,以期发现H3K9三甲基化的修饰与组织特异性的表达、功能和发育具有相关性.方法 通过染色质免疫共沉淀的方法获取各标本DNA,通过qPCR验证ChIP结果,然后构建ChIP Sequencing文库,与目的基因组序列比对,获取比对Reads,接着进行全基因组的Peak分析,GO功能富集分析peak相关基因的生物学功能.结果 心脏和脾脏间有169个基因有显著地H3 K9me3差异,其中心脏中H3 K9me3的基因中有64个特殊基因,脾脏中H3 K9 me3的基因中有87个特殊基因.从这些基因中,挑选出8个表现H3K9 me3明显的基因,然后再从这8个基因中挑选出两个心脏和脾脏间表现H3K9 me3差异最明显的基因,分别是PTPN3和RBMS.结论 H3K9 me3差异可作为一个潜在的生物标志物或是表观遗传疾病的治疗靶点.

关键词：H3K9me3、ChIP-seq、表观遗传学

所属期刊栏目：34

分类号：Q593+.9

资助基金：广西自然科学基金2012GXNSFDA053017;广西科技基础没施建设项目11-031-33;广西重点实验室建设项目12-071-32

在线出版日期：2014-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：939-944