我国柯萨奇病毒A组6型VP1区基因分子流行病学特征

摘要：

目的 分析我国2010-2018年柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区基因流行和进化规律,为手足口病的防治提供科学依据.方法 从GenBank获得2010-2018年我国CV-A6病毒全长VP1区核苷酸序列,用MEGA V7.0和Interactive Tree of Life V5 (iTOLV5)软件构建进化树,用DNAstar V8.1.3软件对核苷酸同源性进行分析.结果 880条序列来源的CV-A6毒株以D3亚型为主,占毒株总数的95.45％,不同基因型核苷酸同源性为80.8％～86.0％,同基因型内核苷酸同源性为88.1％～100.0％.D2亚型VP1区相对稳定,无整体氨基酸变异情况;而D3毒株VP1区发生多点氨基酸替换,其中A5T、T283A、N137S、V242I、A30V、I174V氨基酸替换循环出现,这种进化模式与越南地区相似,但与日本地区却不同.VP1区5T、30A、137N、242V比例逐年增加,可能与CV-A6引起我国手足口的轻症和重症病例比例上升有关.结论 具有VP1区遗传多样性的CV-A6 D3株的出现可能是CV-A6在反复流行的一个重要因素,这有助于解释我国CV-A6的流行情况和流行特点.

关键词：柯萨奇病毒A组6型、VP1区基因、分子流行病学

所属期刊栏目：24

分类号：R181(流行病学与防疫)

资助基金：广西自然科学基金项目2017GXNSFAA198369

在线出版日期：2020-09-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：934-938,945