大气污染物对成人和儿童外周血基因表达谱的影响及生物信息学分析

摘要：

目的 采用生物信息学研究方法分析大气污染物对成人和儿童外周血基因表达谱的影响,为后期开展有针对性的预防、诊断及治疗提供理论依据.方法 从基因芯片公共数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载一组来自不同大气污染暴露下成人和儿童外周血基因芯片数据,将此数据导入分析软件QOE、GenClip、GATH-ER等,分析基因表达谱、蛋白-蛋白相互作用网络、分子生物学过程及基因功能,寻找大气污染对成人和儿童影响的关键节点基因.结果 在暴露源相同的情况下,儿童和成人差异基因不同,成人靶基因主要与细胞增殖、染色体修饰、DNA代谢和染色体组织有关,而儿童靶基因主要与血小板活化、细胞信号传导、有机生理过程等有关.进一步分析发现,FIGNL1、TUBB1、TPST1和SAMHD1基因为成人和儿童共同差异基因,这些基因主要与肿瘤的诱导及抑制有关.结论 不同程度污染对成人和儿童基因产生的影响不同,且在暴露源相同的情况下,儿童和成人差异基因亦不同,成人和儿童共同差异基因主要与肿瘤的诱导及抑制有关.

关键词：大气污染、外周血、基因、生物信息学

所属期刊栏目：22

分类号：R122.7;R349.6;R318.04(环境卫生、环境医学)

资助基金：陕西中医药大学2014年校内科研基金14XJZR07;陕西省科技厅课题2016JM8031;陕西省中医药管理局项目JCMS035

在线出版日期：2018-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：677-681