2016年盐城地区非EV71非CVA16其他肠道病毒分子分型及肠道病毒CVA6型VP1基因特征分析

摘要：

目的 了解2016年盐城地区手足口病非肠道病毒71型(enterovirus,EV71)非柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)其他肠道病毒病原谱分布情况,并对鉴定为肠道病毒CVA6型VP1基因进行分子流行病学研究.方法 对分子分型鉴定为CVA6型的肠道病毒,通过反转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)的方法扩增VP1基因全长编码区,扩增产物经纯化测序,采用相应的生物信息软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析.结果 EV71、CVA16与非EV71非CVA16三者核酸阳性率差异有统计学意义(x2=87.72,P＜0.001).非EV71非CVA16其他肠道病毒基因定型结果显示分属7个基因型CVA4、CVA6、CVA10、埃可病毒3(echovirus 3,E-3)、E-9、E-13、CVB4,分属肠道病毒A、B两组.遗传进化树分析显示,盐城56株CVA6型肠道病毒分属D大分支D3、D4进化分支.其中,54株毒株属D4分支,为国内主流优势流行分支,在D4分支内又聚类成众多细小分支,远离原型株Gdula.结论 2016年盐城市手足病流行的病原谱呈现多样性,有多种基因型的肠道病毒共同流行,CVA6是优势病原体,D4分支的毒株为优势进化分支,形成多条传播链.

关键词：手足口病、柯萨奇病毒感染、基因型、序列分析

所属期刊栏目：22

分类号：R512.57;R181.26(传染病)

资助基金：江苏省卫计委医学青年科研课题Q201513;盐城市医学科技发展计划项目YK2015032

在线出版日期：2018-03-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：52-56