10.16462/j.cnki.zhjbkz.2017.07.006
昆明市静脉吸毒感染者HIV-1env基因C2-V4区序列特征分析
目的 分析昆明市静脉吸毒(intravenous drug user,IDU)感染者艾滋病病毒1型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1) env基因C2-V4区序列特征及代表性广谱单克隆中和抗体(broadly monoclonal neutralizing antibodies,bmNAbs)的表位变异.方法 在昆明市收集165份IDUHIV-1感染者血浆样品,提取RNA,通过逆转录得到cDNA,巢式聚合酶链反应(nested-polymerase chain reaction,nested-PCR)扩增HIV-1膜蛋白基因C2-V4区,应用BioEdit和MEGA等生物信息软件分析所获得序列的特征,并分析2G12、PGT135、PGT128、b12和VRC01等bmNAbs的表位变异.结果 165条序列主要为CRF08_BC (74.55％)和CRF07_BC (23.03％)重组毒株,各可变环变异程度由小到大为V3区＜C3区＜V4区,并且CRF08_BC样本的C2-C4、V3区、C3区和V4区基因离散率分别大于CRF_07BC的相应区域;V3环顶端四肽存在5种类型:GPGQ(95.76％)、GPGR(1.82％)、GPRQ(1.21％)、GPGL(0.61％)和RPGQ(0.61％);辅助受体主要为CCR5 (97.58％).90％以上的CRF08_BC和CRF07_BC重组毒株存在与2G12识别相关的糖基化位点的缺失;而b12、VRC01、PGT135和PGT128等抗体识别的位点在CRF08_BC和CRF07_BC重组毒株中的变异率低.结论 CRF08_BC和CRF07_BC为昆明市IDU感染者的主要流行毒株;CRF08_BC基因离散率高于CRF07_BC毒株;V3区序列变异程度小于C3区及V4区;2G12、PGT135、PGT128、b12和VRC01等代表性bmNAbs表位在CRF08_BC和CRF07_BC毒株存在不同程度的变异.
人免疫缺陷病毒1型、序列分析、流行病学研究
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R181.2;R183(流行病学与防疫)
国家自然科学基金81172809
2017-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共5页
670-674
