10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.11.014
一株人感染H9N2禽流感病毒高通量测序及序列分析
目的 对一株人感染H9N2禽流感病毒进行高通量测序(next-generation sequencing,NGS)分析,探讨其在人群流行的可能性.方法 应用高通量测序技术进行全基因组序列测定(whole genome sequencing,WGS).对8个基因进行相似性检索,构建系统进化树并分析其关键位点的分子特征.结果 8个基因与GenBank基因库相似度最高序列的来源不完全一致,系统进化树显示HA基因属于欧亚系Ⅰ群,M基因位于G1-like分支,PB2位于G9-like分支,NA位于一独立分支,PBI,PA,NP,NS均位于SH/F/98-like分支.HA基因裂解位点为PSRSSR/GLF,226位受体结合位点为L.除M2基因S31N突变之外,NA基因茎63～65位缺失,PA和PB2基因未发生L336M和Q591R,E627K等可以增强病毒对哺乳动物适应性的突变,但发现可以增强病毒毒力的突变如M1基因N30D和T215A,PB2基因L89V,NS1基因P42S.除M2基因S31N突变外,NA基因和M2基因的药物结合位点未发生E119G,R152K,H274Y,R292K和L26F,V27A,A30T,G34E等耐药性突变.HA和NA糖基化位点预测结果都有8个糖基化位点,其中分别有7个和5个可靠程度较高.结论 该H9N2禽流感病毒的大部分关键性位点较保守,只有少部分位点发生一定程度进化与变异,在人群引起流行的可能性不大,但需加强分子方面动态监测.
流感病毒A型、H9N2亚型、序列分析、结合部位
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R373.13(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
广东省中山市科技计划项目2015B1129
2016-12-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
1131-1134,1143
