2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析

摘要：

目的 了解2011-2013年柳州市人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1,HIV-1)亚型分布、流行毒株情况.方法 从2011-2013年柳州市HIV-1毒株样本中采用单纯随机抽样方法抽取120株作为研究对象,将120份样本从血浆中抽提核酸RNA,扩增HIV-1 gag基因片段,送至北京六合华大基因科技股份有限公司测序.合格序列利用数据库分析亚型以及利用MEGA5构建系统进化树.结果 得到合格的gag基因片段98条序列.来自gag基因片段的序列分析重组流行毒株(circulate recombinant forms,CRFs)的重组亚型CRF01 _AE占95.9％ (94/98),异性传播比例为79.8％ (75/94);重组亚型CRF07_BC占4.1％(4/98).样本1LZ022和1LZ032,1LZ025和3LZ029的bootstrap值分别为99.0％,100.0％,两两之间传播途径不同.结论 2011-2013年,柳州市HIV-1以重组亚型CRF01 _AE为主.柳州市重组亚型CRF01_AE从吸毒人群向异性接触感染人群蔓延.利用系统进化关系结合传播途径,便于分析传染源,为艾滋病干预措施提供有力佐证.

关键词：HIV-1、基因、gag、获得性免疫缺陷综合征

所属期刊栏目：20

分类号：R512.91;R181(传染病)

资助基金：广西科学技术厅立项课题1140003A-44

在线出版日期：2016-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：781-784