江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型分子流行病学特征分析

摘要：

目的 了解江苏省2012-2014年柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)流行毒株基因型概况.方法 收集江苏省2012-2014年儿童手足口病标本并送样,进行病毒分离培养获取相应毒株,用CA16特异性引物通过反转录聚合酶链反应技术进行VP1区基因片段扩增和测序,利用生物信息学软件对序列进行分析,并与CA16参比株序列进行同源性比较并构建基因进化树.结果 分离得到82株CA16毒株,测序结果显示全部属于基因亚型B1,VP1基因分析显示其中9株毒株序列的基因亚型为B1a,另外73株毒株序列的基因亚型为B1b.CA16分离株VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为87.8％～100.0％和97.5％～100.0％;与CA16国际标准株G10核苷酸和氨基酸同源性分别为75.2％ ～ 78.2％和90.5％ ～91.9％.结论 江苏省2012-2014年分离获得CA16毒株属于基因亚型B1,以B1a和B1b两个分支共同进化和流行,其中又以B1b为优势亚型.

关键词：手足口病、柯萨奇病毒感染、流行病学、分子

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分类号：R512.57;R394.21;R181(传染病)

资助基金：“十二五”国家科技重大专项2012ZX1002-001;国家自然科学基金青年基金81402732

在线出版日期：2016-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：481-485