hsa-miR-487b的靶基因预测及生物信息学分析

摘要：

目的 对hsa-miR-487b进行靶基因的预测及功能分析,为进一步研究其功能提供线索.方法 应用Pubmed和Google检索hsa-miR-487b相关文献,选择miRanda和TargetScan两种方法预测其靶基因,取其交集,合并已经实验证实的靶基因作为进一步生物信息学分析的基因集合,对此基因集合进行功能富集分析(GO分析)和Pathway分析.结果 hsa-miR-487b序列在各物种间高度保守;其预测靶基因富集于细胞增殖、转录调控、细胞内信号传导、膜转运、染色体的结构及修饰、基因表达调控、酪氨酸激酶活性等共16个生物学过程和功能上(P＜0.05),富集于ErbB信号通路、MAPK信号通路、Fc epsilon RI信号通路、癌症信号通路等7个通路,以及甲状腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌、结直肠癌、急、慢性白血病这些疾病通路中(P＜0.10).结论 hsa-miR-487b可能参与肿瘤发生及预后的生物学过程,为进一步实验性研究提供了线索.

关键词：miR、生物信息学、靶基因

所属期刊栏目：19

分类号：R319;R394(医用一般科学)

资助基金：国家自然科学基金81272293

在线出版日期：2015-02-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：93-95