SARS-CoV中性突变速率和有根系统发育树再研究及其起源的新思考

摘要：

目的 SARS-CoV起源仍未清楚,本文应用系统发育分析方法重建有根系统发育树,比对文献资料,提出SARS-CoV起源的新思考,为最终找到SARS-CoV的真实起源打下基础.方法 在美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)中获取9条SARS-CoV序列.计算其同义替换核苷酸的数量(Ks值),并构建散点图,进行直线拟合,获得SARS-CoV的中性突变速率；进一步计算最近共同祖先日期(time of most recent common ancestor,TMRCA),最后绘制系统发育树.结果 SARS-CoV中性突变速率为7.6× 10-6/位点·天(t=18.95,P＜0.001),R2 =0.98,直线拟合的可信度较高.绘制出的有根系统发育树发现有异常之处,并和有关文献无根树对照,提示SARS-CoV进化上存在“逆向进化”.结论 SARS-CoV在流行中出现“逆向进化”,SARS-CoV的起源可能是非自然性的,可能是非完全动物源性.

关键词：SARS病毒、突变、进化,分子

所属期刊栏目：16

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：全军医药卫生科研基金03F020-1

在线出版日期：2013-01-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：860-862