SARS病毒和其他冠状病毒中性突变速率初步的比较研究

摘要：

目的 比较SARS冠状病毒(SARS-CoV)与第1至第3组(其他3组)冠状病毒的中性突变速率之异同,为更深入研究SARS-CoV起源提供新的思路.方法 在美国国立生物技术信息中心中获取其他3组26条病毒序列,同时选取7条SARS-CoV序列.计算各病毒株5个主要基因串联序列的同义替换核苷酸的数量(Ks值),以此值与时间创建散点图,并进行直线拟合,取得各自中性突变速率并比较.结果SARS-CoV中性突变速率为7.33×10-6/位点·天,而其他3组冠状病毒为2×10-6/位点·天,仅约前者的1/3.5,但决定系数R2极低,无意义.经多种拟合检验,发现标本量和离散性不是本文R2低值的主要原因.结论用同一方法对SARS-CoV和其他3组冠状病毒的中性突变速率进行比较研究,结果显示两者明显不同或具不同的模式；提示和其他3组冠状病毒相比较,SARS-CoV在分子进化或起源模式上似有特别之处.

关键词：SARS病毒、冠状病毒科、中性突变速率

所属期刊栏目：15

分类号：R394.3

资助基金：国家科技部卫生部保密课题2004-2006年度;全军医药卫生科研基金03F020-1

在线出版日期：2012-03-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1026-1030