方法学应用VNTR技术对绵阳地区结核分枝杆菌进行基因分型

摘要：

目的 应用数目可变串联重复序列(variable number of tandem repeats,VNTRs)分析技术探讨绵阳地区结核分枝杆菌的基因分型,为结核病的防治提供科学依据.方法 选取绵阳地区结核分枝杆菌临床分离菌株,采用聚合酶链反应(PCR)分别对VNTR位点进行检测分析,应用BioNumerics 5.0软件进行聚类分析.结果 共对79株结核分枝杆菌的15个VNTR位点进行了检测,结果显示明显的基因多态性.各个位点的分辨能力不同,QUB-11b位点的分辨指数(Hunter-Gaston index,HGI)最高,为0.880;ETR C的HGI最低,为0.234;总HGI达到1.经聚类分析,79株菌可分为7个基因群、79个基因型,以Ⅲ群和Ⅴ群所占比例较大,Ⅲ群含37株菌,占46.8%;Ⅴ群含33株菌,占41.8%,其他菌株呈散在分布.结论 绵阳地区结核分枝杆菌VNTRs基因存在明显的多态性,主要流行菌群为Ⅲ群和Ⅴ群,应加强此两群菌株的监控.

关键词：分枝杆菌、结核、基因分型、串联重复序列

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分类号：R349.6;R183(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：四川省卫生厅课题资助项目080213;绵阳市卫生局课题资助项目200703

在线出版日期：2011-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：810-813