松树内生细菌GD2对松材线虫入侵寄主时转录组的影响

摘要：

为了进一步阐明细菌在松材线虫病中的作用,采用松材线虫(CK)和松材线虫与马尾松内生细菌GD2的混合物(T)分别接种马尾松,对松材线虫进行转录组测序、Gene Ontology(GO)及KEGG富集分析,并利用Real-time Quantitative PCR(RT-qPCR)验证目标基因表达情况.结果显示,与对照组(空白虫)CK相比,共筛选到143个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中有63个上调基因,80个下调基因.Gene Ontology分析显示,差异表达基因在免疫系统过程、细胞膜、代谢过程、转运活性等功能类富集.KEGG通路在ECM-receptor互作、肾素-血管紧张素、糖酵解、胰岛素信号等通路富集.这些GO功能与KEGG通路涉及机体的免疫调节.选取8个基因进行RT-qPCR验证,表达水平与测序结果一致,证明了测序结果的准确性.表明菌株GD2可以通过提高松材线虫的免疫调节能力来影响松材线虫病的发生.

关键词：转录组分析;松材线虫;马尾松内生细菌GD2;差异表达基因;线虫-细菌微生态

所属期刊栏目：40

分类号：S763(森林保护学)

资助基金：国家重点研发计划项目2018YFC1200400

在线出版日期：2021-10-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：37-45