黄单胞菌分泌蛋白的理化性质及特征分析

摘要：

基于全基因组序列已经公布的黄单胞菌Xanthomonas campestris B100、Xanthomonas campestris pv.campestris 8004、Xanthomonas campestris CN14中分泌蛋白序列为基础数据,采用Protscale、SMART、Tar-getP 2.0 Server等生物信息学分析软件对上述分泌蛋白展开理化性质、保守结构域以及转运肽等分析,结果显示:黄单胞菌中分泌蛋白理论等电点与氨基酸长度之间无相关关系,44.73％的蛋白为不稳定蛋白,83.21％的蛋白亲水性小于0,属于亲水性蛋白.同时,在每种黄单胞菌的分泌蛋白中,具有明显保守结构域的蛋白数量平均为12个,并且所有分泌蛋白均具有信号肽,转运肽预测可能性分布也较为平均.

关键词：黄单胞菌、分泌蛋白、理化性质、生物信息学分析、植物病原菌、亚细胞定位、转运肽

所属期刊栏目：39

分类号：S435.1(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金项目;云南省应用基础研究计划项目;云南省研发经费投入补助项目

在线出版日期：2020-12-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：30-36