甘蔗鞭黑粉菌致病力差异菌株转录组分析
为探明甘蔗鞭黑粉菌不同致病力菌株在转录水平的差异,挖掘致病相关基因,采用Illumina测序技术对2个不同致病力菌株Ss16(强致病力)和Ss47(弱致病力)构建cDNA文库,进行转录组测序,通过质控后对其进行生物信息学分析.结果显示:共获得8.31G(Ss16)和9.88G(Ss47)的分析数据(clean reads),Ss16和Ss47相比较共获得显著(P<0.05)差异表达基因649个,其中上调基因299个,下调基因350个.差异性表达基因的GO注释及KEGG通路富集分析结果表明,KEGG通路多与物质的蛋白合成、运输和代谢相关,富集最显著的前几条通路分别为:淀粉和蔗糖代谢(starch and sucrose metabolism)、ABC转运蛋白(ABC transporters)、芳香族化合物的降解(degradation of aromatic compounds)、代谢途径(metabolic pathways)和嘌呤代谢(purine metabo-lism).
甘蔗、鞭黑粉菌、转录组、致病相关基因、差异表达基因、生物信息学分析
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S435.661(病虫害及其防治)
国家自然科学基金项目;广东省甘蔗剑麻产业技术体系创新团队项目
2020-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
54-59
