二倍体和四倍体泥鳅qRT-PCR分析中内参基因优选

摘要：

为筛选在泥鳅中稳定表达的内参基因,以确保泥鳅基因表达分析结果的可靠性,选取ACTB、TU-BA、EF1A、GAPDH、TUBB和18S rRNA 6个常用的内参基因作为候选内参基因,分别用BestKeeper、geNorm、NormFinder、ΔCt和RefFinfer软件分析这6个基因在二倍体和四倍体泥鳅胚胎发育阶段、成鱼组织间以及倍性间表达的稳定性.结果显示,在胚胎发育各阶段,TUBB和TUBA的表达最稳定,可作为胚胎发育阶段qRT-PCR分析的内参基因;其中,TUBB在泥鳅倍性间的表达差异不显著,因此,可作为泥鳅胚胎发育中跨倍性qRT-PCR研究的内参基因.在成鱼各组织中,ACTB和18S rRNA的表达最稳定,可用作组织间qRT-PCR分析的内参基因;其中,18S rRNA在倍性间的组织表达差异不显著,因此,可作为泥鳅组织间跨倍性qRT-PCR的内参基因.

关键词：泥鳅、二倍体、四倍体、多倍体鱼类、表型变异、基因表达变异、qRT-PCR、内参基因、稳定表达

所属期刊栏目：38

分类号：Q959.46+8(动物学)

资助基金：国家重点研发计划"蓝色粮仓科技创新"重点专项2018YFD0900205

在线出版日期：2019-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-8