基于全基因组序列预测里氏木霉QM6a的分泌蛋白

摘要：

里氏木霉(Trichoderma reesei)QM6a为重要的产纤维素酶工业生产菌株,为明确其内存在的分泌蛋白,对该菌分泌蛋白进行预测,并明确其特征.利用SignalP、ProtComp等5个软件对该菌中9 143条蛋白质序列进行分泌蛋白预测,并对上述分泌蛋白的氨基酸大小分布情况、信号肽长度及其切割位点等性质进行分析.里氏木霉中含有分泌蛋白356个,其氨基酸长度、信号肽长度与其他植物病原菌不同;信号肽切割位点属于A-XA类型,与其他已经报道的植物病原真菌、细菌以及卵菌中分泌蛋白信号肽切割位点一致.通过上述生物信息学分析方法有效地实现了里氏木霉分泌蛋白的预测,也证明了分泌蛋白的信号肽切割位点具有物种保守性特点.

关键词：里氏木霉、分泌蛋白、信号肽、预测软件

所属期刊栏目：36

分类号：S436.341(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金项目31560211;云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目ZK150004;云南省教育厅科学研究基金项目2014Y330;云南省科技计划项目2015IA005,2015IA004

在线出版日期：2017-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：28-32