猪流行性腹泻病毒变异株(CH/YNKM-8/2013)的分离鉴定和全基因组序列分析

摘要：

为研究猪流行性腹泻病毒(PEDV)变异株特性,通过细胞培养、细胞病变(CPE)观察、RT-PCR、间接免疫荧光实验和透射电镜观察分离鉴定1株PEDV变异株(CH/YNKM-8/2013株)并分析了全基因组序列.运用基因组分段扩增方法,测得该毒株的全基因组序列(GenBank登录号为KF761675.1).该毒株S基因N端比CV777毒株S基因的N端长9 bp,包括15 bp的插入和6 bp的缺失,表明CH/YNKM-8/2013为变异毒株.同源性分析显示,该毒株的基因组序列与我国广东2011年分离毒株LC的同源关系最近,相似性为99.6％,与韩国毒株KNU-1305和美国毒株USA/Minnesota84/2013的序列相似性均为99.0％,而与CV777疫苗毒株的相似性较低,为96.7％.序列进化树分析表明该毒株和我国新近毒株、韩国及美国的变异毒株进化关系较近,而与我国之前流行的PEDV毒株以及疫苗毒株CV777处于不同分支.

关键词：猪流行性腹泻病毒、变异毒株、分离、鉴定、全基因组序列分析

所属期刊栏目：35

分类号：S852.65+1(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家现代产业生猪技术体系项目CARS-36;国家自然科学基金项目31272572

在线出版日期：2016-07-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：93-99