猪抗酶1基因核心启动子区鉴定及单倍型转录活性比较

摘要：

通过双荧光素酶报告基因载体系统检测猪抗酶1(AZ1)基因启动子转录活性,分析蓝塘和长白猪群体AZ1基因启动子SNP及单倍型,在此基础上比较不同单倍型转录活性.结果表明:-453/+79为核心启动子区;在2个群体中检测到AZ1基因启动子8个SNPs,分别为-713 T＞C、-584 A＞C、-476 G＞A、-365 T＞C、-348 C＞T、-294G＞C、-288 T＞G和-234T＞C,蓝塘猪群体具有更丰富的单核苷酸多态性,而长白猪群体仅在-288座位存在GG和GT 2种基因型,其他7个SNPs均为纯合状态;蓝塘猪群体LTH1单倍型(TAGCCGTC,-713/-234)频率为0.526,为蓝塘猪优势单倍型,其次为LTH2 (TAGCCGTT),频率为0.166;长白猪群体优势单倍型为Landrace-H(TAGTCGGT),频率为0.939.LTH1转录活性高于LTH2和Landrace-H,推测-234 T＞C、-365 T＞C和-288 T＞G座位是造成不同单倍型转录活性差异的原因.

关键词：猪、抗酶(AZ1)基因、启动子、SNP、单倍型

所属期刊栏目：35

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：国家自然科学基金项目31201771;现代农业产业技术体系专项CARS-36

在线出版日期：2016-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：94-100