尖孢镰刀菌甜瓜专化型基因组规模分泌蛋白的预测与分析

摘要：

利用SignalP、WoLF PSORT、TMHMM、big-PI Predictor、TargetP和SecretomeP等软件,对尖孢镰刀菌甜瓜专化型(Fusarium oxysporum f.sp.melonis,FOM)全基因组26811条蛋白质氨基酸序列进行了分泌蛋白的预测分析.结果表明,FOM全基因组编码蛋白中有1145个经典分泌蛋白,占编码蛋白总数的4.3％;有8 471个非经典分泌蛋白,占编码蛋白总数的31.6％.对经典分泌蛋白特征进行分析,发现其氨基酸长度集中在100～600个氨基酸,信号肽长度集中在17～22个氨基酸.对经典分泌蛋白的功能预测分析表明,有605个分泌蛋白获得了注释,主要涉及糖代谢、转运过程、过氧化氢代谢和生物合成等.对碳水化合物酶类(CAZymes)进行分析,结果表明有277个分泌蛋白为CAZymes,占经典分泌蛋白总数的24.2％.

关键词：尖孢镰刀菌甜瓜专化型、分泌蛋白、信号肽、碳水化合物酶类、蛋白功能预测

所属期刊栏目：35

分类号：S435.111.41(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金项目30971887;广东省普通高校青年创新人才项目粤教科函[2015]3号

在线出版日期：2016-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：24-29