利用CR和Cyt b基因序列组合评价珠江和长江水系赤眼鳟的遗传多样性

摘要：

利用PCR技术扩增得到珠江和长江水系共24个赤眼鳟( Squaliobarbus curriculus)个体mtDNA CR和Cyt b基因片段,并测定其序列。对1345 bp的组合序列进行分析,共检测到23个单倍型,22个单突变位点,102个简约信息位点。在139个突变位点中：转换位点100个,颠换位点30个,插入/缺失位点14个；A+T的含量(61.5%)明显高于C+G的含量(38.5%)。4个水域个体间的遗传变异率在0~7.43%之间,组合序列的单倍型多样性(H)、平均核苷酸差异数(K±SD)和核苷酸多样性(π)分别为0.9778、17.2710和0.0297,均表现出较高的遗传多样性水平。对4个群体的组合序列进行FST 分析,并构建分子系统树和单倍型进化网络关系图。结果表明：不同水系群体间存在显著遗传差异,而同一水系内的不同群体间差异不显著。 AMOVA分析表明：梧州、新丰、武汉和宜昌4个群体间显著性的遗传分化主要由不同水系群体间的遗传差异所致,珠江或长江流域内群体间不存在遗传分化,进一步印证了FST 的分析结果。珠江和长江水系间的遗传分化主要是因地理隔离导致的生殖隔离,分属“长江群体”或“珠江群体”。但在同一水系内,主要因为赤眼鳟的半洄游习性使得它们之间存在广泛的基因交流,没有出现遗传分化。

关键词：赤眼鳟、线粒体DNA、CR、Cyt b、遗传多样性、珠江、长江

分类号：Q953.5(动物学)

资助基金：农业部公益性行业专项201303048;国家科技基础条件平台建设项目2008DKA30470-010;农业部渔业生态环境重点开放实验室开放基金24-9;广东省海洋渔业科技推广专项A201201E04

在线出版日期：2014-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：84-91