猪繁殖与呼吸综合征病毒YA株ORF5基因的克隆与序列分析

摘要：

以猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)YA株为材料,采用RT-PCR扩增其ORF5基因全长cDNA并进行序列测定和比较分析.结果YA株ORF5基因cDNA编码区长603 bp,可编码200个氨基酸残基.与欧洲型代表株LV株、美洲型代表株VR-2332株在氨基酸水平上的同源性分别为58%和90%,与国内首株分离株(CH-1a)的同源性高达95%,推测YA株属于美洲型.根据YA株ORF5基因编码的氨基酸序列,与具有代表性的12株美洲型毒株和2株欧洲型毒株绘制进化系统树,结果也显示YA株与美洲型分离毒株的遗传关系较近,而与欧洲型毒株的遗传关系较远.进一步采用序列分析软件对推导的氨基酸进行比较分析,发现YA株ORF5编码的E蛋白存在5个潜在的N-糖基化位点,6个抗原位点,其糖基化位点的数目及抗原位点的分布与其它美洲型毒株均存在一定程度的差异,但3个最主要的抗原表位相对保守.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、ORF5基因、克隆、序列分析

所属期刊栏目：21

分类号：S850(动物医学（兽医学）)

资助基金：湖北省武汉市青年科技晨光计划20025001041

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：501-505