基于16S rRNA与COI基因40种石斑鱼亚科鱼类分子系统进化关系

摘要：

本研究采集了分布在西太平洋的石斑鱼亚科10属共40种鱼类,采用PCR扩增及测序技术获得所有样品16S rRNA、COI基因部分序列,利用最大似然法构建系统进化树并分析.结果表明:40种鱼类COI基因为651 bp,编码227个氨基酸,16S rRNA基因同源序列566 bp,序列存在一定的碱基插入与缺失,各物种16S rRNA基因序列变异比COI要少,序列较为保守.构建的系统进化树上,在本研究的石斑鱼亚科10个属中,鳃棘鲈属分类地位最原始,位于进化树基部,6种鳃棘鲈能聚成一个单系;烟鲈属与九棘鲈属关系较近,两者聚为一支,侧牙鲈属的进化地位介于鳃棘鲈属与九棘鲈属之间;石斑鱼属的进化地位最高,位于进化树顶部,形成两个平行分支,但是石斑鱼属种类未能聚成一个单系;驼背鲈属、鸢鮨属、下美鮨属、光腭鲈属及宽额鲈属均未能形成独立分支,而是与石斑鱼属种类聚在一起,显示其与石斑鱼属有很近的亲缘关系,部分可能是石斑鱼属的特化类群.

关键词：石斑鱼亚科、16SrRNA、COI、系统进化

所属期刊栏目：42

分类号：P714+.5;Q344.13(海洋调查与观测)

资助基金：国家自然科学基金 ;广东省自然科学基金 ;广东省重点领域研发计划项目 ;广东省科技计划

在线出版日期：2020-07-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：9-19