病毒感染海洋球石藻Emiliania huxleyi的转录组分析

摘要：

海洋球石藻Emiliania huxleyi及其特异性裂解病毒E.huxleyi virus (EhVs)在调节海洋碳、硫循环及全球气候变化中起着重要作用,也是开展真核生物病毒-宿主相互作用研究的良好模型系统之一.为了探究病毒感染条件下E huxleyi基因表达水平的变化,以海洋球石藻Ehuxley-BOF 92及其专一性裂解病毒EhV-99Bl为研究对象,利用Illumina HiSeq 2000高通量测序技术,分别对E.huxleyi病毒感染组(Exp)和非感染对照组(Con)6 h和45 h的藻细胞样品进行转录组测序分析.共得到32 909条平均长度为1 153 bp的基因.病毒感染6h和45 h分别得到2 617和5 229个差异表达基因,其中共差异表达基因465个.随机选取10条差异表达基因,采用qRT-PCR进行实验验证,结果证实转录组分析可靠.GO功能注释和KEGG通路富集,发现大量基因与氧化应激反应、脂类代谢、碳水化合物代谢及信号转导等代谢过程相关,其中变化最显著的是谷胱甘肽代谢途径.从病毒感染球石藻转录组中筛选出部分与氧化应激反应相关的基因,其中9个基因显著上调,11个基因显著下调,表明宿主能够通过体内的氧化应激反应响应病毒胁迫.

关键词：海洋球石藻Emiliania huxleyi、病毒感染、转录组、差异表达基因、qRT-PCR、氧化应激反应

所属期刊栏目：41

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金项目;福建省自然科学基金项目

在线出版日期：2020-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：103-112