鳗鲡目鱼类线粒体蛋白质编码基因易位及系统演化关系分析

摘要：

鳗鲡目鱼类线粒体基因组的基因组成较为保守,在58个线粒体基因组中,仅有3个物种存在基因数量的差异.在19个鳗鲡目鱼类线粒体基因组中存在主编码基因的重排.主编码基因的变异位点分析结果支持nad5、had4和had2基因作为cox1和lrRNA基因辅助的分子标记.鳗鲡科Anguillidae的20个种(亚种)聚在一起,强烈支持鳗鲡科为单系群(BPP=100).鳗鲡科下属的3个类群(大洋洲类群、大西洋类群和印度洋太平洋类群)也同时得到有力的验证(BPP均为100).线鳗科Nemichthyidae和锯齿鳗科Serrivomeridae亲缘关系最近,二者聚类后,与鳗鲡科Anguillidae构成姊妹群(BPP=100).在囊喉鱼亚目Saccopharyngoidei中,宽咽鱼科Eurypharyngidae与囊鳃鳗科Saccopharyngidae聚类(BPP=100),同时,单颌鳗科Monognathidae与月尾鳗科Cyematidae聚类(BPP=100),4个科聚在一支,支持囊喉鱼亚目为单系群(BPP=100).在囊喉鱼亚目线粒体基因组中,3个物种(吞鳗Eurypharynx pelecanoides、拉文囊鳃鳗Saccopharynxla venber gi和杰氏单颌鳗Monognathus jesperseni)存在主编码基因的重排.16种鳗鲡(细美体鳗Ariosoma shiroanago、短吻颈鳗Derichth ys serpentinus、凯氏短尾康吉鳗Coloconger cadenati、鸭颈鳗Nessorhamphus ingol fianus、龟草鳗Thalassenchelys sp.、粗犁齿海鳗Cynoponticus erox、百吉海鳗Muraenesox bagio、巨斑花蛇鳗Myrichth ys maculosus、大吻沙蛇鳗Ophisurus macrorh ynchos、几内亚副康吉鳗Paraconger notialis、哈氏异康吉鳗Heteroconger hassi、小头鸭嘴鳗Nettastoma parviceps、弱头鳗Leptocephalus sp.、斑点长犁齿鳗Hoplunnis punctata、尖吻小鸭嘴鳗Facciolella oxyrh yncha和星康吉鳗Congerm yriaster),与鳗鲡目线粒体主编码基因的原始排列相比,共享had6基因的易位.同时,基于线粒体基因组13个蛋白质编码基因构建的系统演化树,强烈支持这16个物种聚为一支(BPP=100).然而,由此而带来的海鳗科Muraenesocidae、拟鯙科Chlopsidae和糯鳗科Congridae是否为单系群的问题,值得今后深入探究.

关键词：鳗鲡、蛋白质编码基因、基因易位、系统演化关系

所属期刊栏目：36

分类号：Q959.46+9(动物学)

资助基金：国家自然科学基金40906067;香江学者计划XJ2012056;中国博士后科学基金2012M510054,2012T50218;中央财政支持地方高校发展专项资金CXTD04;江苏省“青蓝工程”人才基金资助项目苏教师[2010]27号;江苏高校优势学科建设工程资助项目

在线出版日期：2014-05-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：73-81