基于ITS序列分析的赤潮异弯藻(Heterosigma akashiwo)分子鉴别

摘要：

对五株赤潮异弯藻核糖体转录单元内间隔区(ITS区)进行了PCR扩增和序列测定,并结合GenBank中收录的所有赤潮异弯藻ITS序列信息,比较了它们的遗传距离和相似系数,同时结合GenBank中发布的针胞藻纲其他三个属的代表种ITS序列信息,采用邻接法(neighl)OUr.joining,NJ)和最小进化法(minimum evolution,ME)构建系统发育树.结果表明,五株赤潮异弯藻ITS全序列总长度及碱基组成完全一致,均为538 bp,与GenBank中收录的四株赤潮异弯藻仅有一个碱基不同,遗传距离和相似系数分别为0.002和0.980,而与其他赤潮异弯藻ITS序列完全相同,遗传距离和相似系数分别为0.000和1.000.用两种方法构建的系统发育树结构完全一致,赤潮异弯藻属与海洋卡盾藻属亲缘关系较近,而与另外两属的亲缘关系较远.

关键词：赤潮异弯藻、ITS、分子鉴定

所属期刊栏目：30

分类号：Q949.2(植物学)

资助基金：国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室基金资助项目200504

在线出版日期：2009-03-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：107-112