鲤多拷贝基因MRC1的全基因组鉴定及表达分析

摘要：

甘露糖受体C1型基因(mannosereceptor C-type 1,MRC1)是C型凝集素超家族的成员之一,其编码的甘露糖受体是一种模式识别受体,在先天免疫反应中发挥关键作用.MRC1基因在哺乳动物免疫反应中的作用被广泛研究,但在鱼类中的研究较少.近年来,随着高密度集约化养殖模式的发展,由病原微生物引发的疾病频繁暴发,其中,嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)是常见的致病菌之一.本研究首次在鲤(Cyprinus carpio)全基因组范围鉴定MRC1基因,共发现11个基因拷贝,并进行了功能域预测、共线性分析、多序列比对和系统进化分析,结果表明,MRC1基因在物种进化过程中保守程度较高.拷贝数比较分析发现,MRC1基因在不同物种中表现出不同程度的多拷贝现象,在多数鱼类中发现2个拷贝,而在鲤中发现多达11个拷贝.同时,比较了各拷贝在健康鲤脑、肌肉、肝脏和脾脏组织中的表达情况,发现在免疫相关组织脾脏中的表达量相对高于其他组织.进一步对感染嗜水气单胞菌4、12、24h后在鲤脾脏中的表达进行差异比较分析,发现不同拷贝的表达特征各有差异,其中,HHLG13g0734在感染嗜水气单胞菌4 h后表达显著上调,HHLG13g0734在感染24 h后表现出极显著上调,HHLG3g0497在整个感染过程中表达显著下调,表明鲤MRC1基因只有部分拷贝保留了免疫相关功能及参与机体的免疫反应.本研究结果有助于进一步了解鲤MRC1基因在抵抗嗜水气单胞菌感染过程中发挥的免疫功能,并为分子选育抗病新品系提供一定的数据基础.

关键词：鲤、甘露糖受体C1型、多拷贝基因、系统进化树、嗜水气单胞菌

所属期刊栏目：45

分类号：S964(水产养殖技术)

资助基金：农业农村部财政专项;中国水产科学研究院基本科研业务费共同资助

在线出版日期：2024-01-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：85-94