基于转录组测序技术挖掘长吻生长关键基因

摘要：

为挖掘我国名优鱼类长吻(Leiocassis longirostris)生长相关基因,本研究运用Illumina高通量测序技术比较分析了快速生长组[平均体质量为(534.02±53.68)g]和缓慢生长组[平均体质量为(108.41±4.96)g]各9尾长吻的脑组织基因表达谱.测序共获得267 404 674个高质量测序片段(clean reads),通过2种不同生长速率长吻脑组织转录组比较筛选出518个差异表达基因,其中,412个基因表达量上调,106个基因表达量下调.对12个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证的结果与转录组测序结果一致.GO功能分类显示,大量差异表达基因富集到生长(growth)、生长因子活性(growth factor activity)和激素介导的信号通路(hormone-mediated signaling pathway)GO 条目中.KEGG富集分析显示,一些差异表达基因在MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、转化生长因子β信号通路(TGF-beta signaling pathway)、钙离子信号通路(calcium signaling pathway)和神经活性配体-受体相互作用(neuroactive ligand-receptor interaction)等途径中富集.根据GO功能注释和KEGG富集分析,筛选出gnrh、thr、egrl、fgf18、sst、gipr、cart和 crf等基因是调控长吻生长发育的关键候选基因.本研究结果为后续深入研究长吻生长调控机制提供了重要的参考资料.

关键词：长吻、鱼类生长、转录组测序、神经内分泌因子

所属期刊栏目：44

分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;重庆市自然科学基金;重庆市水产科技创新重点攻关项目;重庆市大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2023-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：125-136