嗜水气单胞菌感染翘嘴鳜头肾转录组分析

摘要：

嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)是严重危害翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)养殖生产的主要病原之一,为揭示嗜水气单胞菌感染翘嘴鳜后宿主基因表达水平的变化,筛选免疫相关基因,解析翘嘴鳜应答病原细菌感染的分子机制,本研究以病原嗜水气单胞菌感染翘嘴鳜,于感染24 h后,采集感染组与对照组翘嘴鳜头肾组织,采用Illumina Hiseq 2000进行了 RNA-Seq分析,原始数据拼接后组装共获得53 040个单基因(unigene).基因差异表达分析结果显示,感染组和未感染组翘嘴鳜存在526个差异表达基因,包括254个上调基因和272个下调基因,其中,免疫相关的显著上调的差异基因主要有炎症和免疫原性细胞因子白介素、补体系统、MHCⅠ型抗原提呈、溶菌酶、丝氨酸蛋白酶抑制因子、泛素蛋白连接酶等.GO富集分析发现,差异基因主要涉及免疫应答反应和炎症反应等,经KEGG富集分析显示,89个通路富集显著,免疫相关的代谢通路主要有内吞作用和吞噬体等.此外,实时荧光定量PCR验证结果表明,所选取7个差异表达免疫相关基因与RNA-seq结果具有相似的表达趋势.本研究为揭示翘嘴鳜对病原微生物感染的防御分子机制奠定了理论基础.

关键词：翘嘴鳜、嗜水气单胞菌、转录组、差异表达基因

所属期刊栏目：43

分类号：S917.1(水产基础科学)

资助基金：江苏省农业科技自主创新资金项目CX182012

在线出版日期：2022-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：208-217