中国对虾ATG5基因的克隆及其在pH、碳酸盐碱度胁迫下的表达分析

摘要：

采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)ATG5基因cDNA全长,命名为FcATG5.利用实时荧光定量技术分析了 FcATG5的组织表达及其在pH和碳酸盐碱度胁迫下的表达特征,并利用RNAi技术验证其功能.基因分析显示,FcATG5 cDNA全长为2225 bp,开放阅读框为810 bp,编码269个氨基酸,预测其编码的蛋白质分子量为31.103 kDa,理论等电点为5.59,为疏水性蛋白,包含1个APG5自噬相关蛋白结构域,无跨膜结构,不包含信号肽.同源性和系统进化分析显示,FcATG5具有高度保守性,与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)同源性最高(98.14％).组织表达分析显示,FcATG5在中国对虾各组织中均有表达,肌肉中表达量最高(P＜0.05),血淋巴细胞中最低(P＜0.05).pH胁迫后48 h,FcATG5在鳃中的表达量最低,为对照组的1.68倍;胁迫后96 h最高,为对照组的2.67倍.碳酸盐碱度胁迫后12 h,FcATG5在鳃中表达量最高,为对照组的2.77倍;胁迫后96h最低,为对照组的1.30倍.干扰实验结果显示,pH和碳酸盐碱度胁迫下,沉默FcATG5基因会使中国对虾死亡率显著增高(P＜0.05),表明该基因的表达量越高,越有利于中国对虾存活.实时定量结果表明,FcATG5在pH、碳酸盐胁迫下的表达量均显著升高(P＜0.05),推测自噬可能参与中国对虾应对非生物胁迫的调控.本研究结果对水生动物特别是甲壳动物中细胞自噬研究具有重要的借鉴意义,有助于推进中国对虾盐碱水养殖的研究进程.

关键词：中国对虾、FcATG5、pH胁迫、碳酸盐碱度胁迫、RNAi

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分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;农业部中央级公益性科研院所基本科研业务费项目;山东省重点研发计划项目;中央提前下达渔业成品油价格改革财政补贴项目

在线出版日期：2022-06-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：84-94